71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1563 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1563  cytochrome c-like protein  100 
 
 		 145 aa  292  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2754  Cytochrome c-like protein  37.04 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0564833  hitchhiker  0.0019216 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0286  OmpA/MotB  34.04 
 
 		 329 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0885  cytochrome C  29.79 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.42 
 
 		 689 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 698 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  35.23 
 
 		 708 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  35.79 
 
 		 669 aa  59.3  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  32.97 
 
 		 675 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  32.98 
 
 		 721 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.33 
 
 		 699 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  30.23 
 
 		 272 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  32.98 
 
 		 721 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  32.98 
 
 		 694 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  31.68 
 
 		 773 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  32.97 
 
 		 691 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.09 
 
 		 726 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  32.95 
 
 		 675 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  31.68 
 
 		 728 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  34.88 
 
 		 304 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  34.88 
 
 		 304 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  34.88 
 
 		 304 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1092  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 333 aa  53.9  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  32.58 
 
 		 304 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0320  cytochrome c family protein  29.79 
 
 		 369 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0353  cytochrome c family protein  29.79 
 
 		 357 aa  53.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1476  cytochrome c class I  27.38 
 
 		 317 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  27.94 
 
 		 327 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  26.47 
 
 		 327 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 712 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4159  putative sulfur oxidation protein (SoxA); cytochrome c precursor  28 
 
 		 288 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1187  cytochrome C  31.51 
 
 		 79 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0128  putative cytochrome C  30 
 
 		 352 aa  50.8  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0408235  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4256  hypothetical protein  41.33 
 
 		 272 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0573  cytochrome c class I  27.47 
 
 		 355 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0568  cytochrome c class I  27.08 
 
 		 355 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0544  cytochrome c class I  27.47 
 
 		 355 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0624  cytochrome c, class I  27.08 
 
 		 355 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000503789  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3431  cytochrome c, class I  29.55 
 
 		 351 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2105  cytochrome c, class I  30.21 
 
 		 315 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3606  cytochrome c family protein  28.92 
 
 		 352 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4047  cytochrome c family protein  27.66 
 
 		 351 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0408  cytochrome c, class I  29.03 
 
 		 313 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4961  hypothetical protein  38.67 
 
 		 273 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379362  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0520  cytochrome c, class I  28.92 
 
 		 351 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1309  diheme-containing SoxA-like protein  27.47 
 
 		 346 aa  45.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  27.78 
 
 		 293 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1522  hypothetical protein  38.03 
 
 		 276 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.56386 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2490  cytochrome c class I  29.27 
 
 		 343 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1496  cytochrome c class I  27.27 
 
 		 308 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4372  hypothetical protein  36.84 
 
 		 272 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.692073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1906  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  28 
 
 		 294 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.556317  normal  0.0839186 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3714  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  28 
 
 		 294 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.873772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2378  cytochrome c, class I  23.53 
 
 		 282 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000643985  hitchhiker  0.0000202689 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2583  cytochrome c class I  29.27 
 
 		 407 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1278  cytochrome c, class I  29.27 
 
 		 407 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0536255  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4606  cytochrome c, class I  27.5 
 
 		 309 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000163718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3545  cytochrome c family protein  26.04 
 
 		 372 aa  43.5  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4873  cytochrome c class I  25.84 
 
 		 306 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  26.67 
 
 		 291 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3674  putative sulfur oxidation protein (SoxA)  26.51 
 
 		 274 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2825  cytochrome c, class I  29.41 
 
 		 329 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.137044  hitchhiker  0.000380249 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0805  hypothetical protein  33.8 
 
 		 270 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0527  cytochrome c family protein  25.27 
 
 		 352 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000661478  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003030  cytochrome c family protein  24.78 
 
 		 350 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  27.47 
 
 		 310 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1184  cytochrome c, class I  31.31 
 
 		 337 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3420  hypothetical protein  35.79 
 
 		 291 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3256  hypothetical protein  33.8 
 
 		 270 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1034  hypothetical protein  25.17 
 
 		 271 aa  40  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.53712  normal  0.936486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>