54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1034 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1034  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  567  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.53712  normal  0.936486 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0805  hypothetical protein  86.35 
 
 		 270 aa  486  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2434  hypothetical protein  58.37 
 
 		 269 aa  332  3e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2627  hypothetical protein  59.04 
 
 		 271 aa  323  3e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3420  hypothetical protein  58.33 
 
 		 291 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3252  hypothetical protein  58.23 
 
 		 275 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3780  hypothetical protein  57.32 
 
 		 269 aa  309  4e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3454  hypothetical protein  53.85 
 
 		 273 aa  309  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3126  hypothetical protein  53.48 
 
 		 273 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3256  hypothetical protein  51.85 
 
 		 270 aa  290  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2281  hypothetical protein  54.07 
 
 		 271 aa  288  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870849  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1594  hypothetical protein  53.66 
 
 		 271 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0731663  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1670  hypothetical protein  53.25 
 
 		 271 aa  285  7e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3130  hypothetical protein  50.77 
 
 		 271 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4256  hypothetical protein  47.41 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4961  hypothetical protein  47.74 
 
 		 273 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379362  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0857  hypothetical protein  44.49 
 
 		 271 aa  234  9e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798826  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4372  hypothetical protein  45.76 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.692073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1522  hypothetical protein  47.62 
 
 		 276 aa  225  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.56386 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2859  hypothetical protein  37.96 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0855  hypothetical protein  40.93 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.102489  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3453  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  34.7 
 
 		 259 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3449  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  36.29 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2863  hypothetical protein  39.13 
 
 		 265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0853  hypothetical protein  37.13 
 
 		 277 aa  161  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00963426  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0432  hypothetical protein  34.05 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0514  hypothetical protein  30.04 
 
 		 268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000430045  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1908  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  30.17 
 
 		 301 aa  94.7  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000720789  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0564  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  31.76 
 
 		 281 aa  90.5  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000710636  normal  0.452243 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1906  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  29.01 
 
 		 294 aa  85.5  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.556317  normal  0.0839186 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3714  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  29.01 
 
 		 294 aa  85.5  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.873772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0263  diheme cytochrome SoxA  28.14 
 
 		 256 aa  85.5  9e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000154217  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4153  diheme cytochrome c SoxA  26.81 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2804  diheme cytochrome c  24.34 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.244051 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0918  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  30.77 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222213  normal  0.890143 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1154  putative cytochrome c  24.37 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.689886  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7671  putative diheme cytochrome c; sulfur oxidizing protein SoxA  27.17 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4159  putative sulfur oxidation protein (SoxA); cytochrome c precursor  27.31 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0063  putative cytochrome c  24.73 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0694  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  30.43 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3673  sulfur oxidation protein  29.26 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3915  secreted protein-like protein  27.62 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.536069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3674  putative sulfur oxidation protein (SoxA)  24.56 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0143  sulfur oxidation protein  28.96 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2761  putative diheme cytochrome C  23.89 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3046  hypothetical protein  27.62 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0601  sulfur oxidation protein SoxA  25.79 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0517322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6959  putative diheme cytochrome c; sulfur oxidizing protein SoxA  25.33 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0313  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  22.4 
 
 		 239 aa  52.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.450378  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0814  sulfur oxidation protein SoxA  28.1 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022188  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1925  sulfur oxidation protein SoxA  27.32 
 
 		 285 aa  49.3  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1948  hypothetical protein  23.81 
 
 		 484 aa  46.2  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0193  cytochrome c, class I  32.58 
 
 		 327 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1476  cytochrome c class I  32.38 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>