49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0590 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0590  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
380 aa  742    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.248802  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3140  zinc carboxypeptidase A metalloprotease (M14)  37.98 
 
 
357 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0299032 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3496  Zinc carboxypeptidase A metalloprotease (M14)  37.2 
 
 
503 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4909  group 1 glycosyl transferase  27.08 
 
 
364 aa  122  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0821  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.534399  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1188  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 
360 aa  86.7  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01298  predicted glycosyltransferase  21.97 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.65788  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4124  glycosyl transferase, group 1  23.42 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  23.57 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 
386 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3679  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
375 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  33.2 
 
 
372 aa  63.2  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4450  GumI protein  29.86 
 
 
350 aa  60.5  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
375 aa  60.1  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  31.58 
 
 
364 aa  57.4  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01399  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumI  27.68 
 
 
349 aa  57  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.490868  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
379 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
392 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  30.87 
 
 
393 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
350 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 
401 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3865  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
666 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1369  hypothetical protein  25.25 
 
 
335 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
359 aa  53.1  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
381 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
366 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
358 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  27.31 
 
 
375 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
381 aa  50.8  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  19.08 
 
 
378 aa  50.1  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
364 aa  49.7  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
366 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0168  glycosyl transferase  31 
 
 
374 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 
789 aa  47.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
394 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  29.73 
 
 
384 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1369  Glycosyltransferase-like protein  30.52 
 
 
357 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3533  glycosyl transferase, group 1 family protein PslF  25.91 
 
 
392 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0609585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
378 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  22.69 
 
 
374 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3362  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
393 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
384 aa  43.9  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 
382 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  37.21 
 
 
408 aa  43.9  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3532  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 
428 aa  43.5  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00173558  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
790 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0743  putative glycosyl transferase  35.24 
 
 
421 aa  43.5  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136224  hitchhiker  0.00617937 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
381 aa  43.1  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>