51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4469 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4469  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  318  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269048  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3139  hypothetical protein  37.17 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010598  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2177  hypothetical protein  36.84 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669035  normal  0.0733999 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2273  hypothetical protein  36.44 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2412  hypothetical protein  33.91 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1165  hypothetical protein  34.21 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.273556  normal  0.0258081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2995  hypothetical protein  38.89 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1307  protein of unknown function DUF419  39.29 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.233005  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3006  hypothetical protein  32.74 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7256  hypothetical protein  28.18 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058114  normal  0.411835 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0843  hypothetical protein  31.03 
 
 
128 aa  62.8  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0459  protein of unknown function DUF419  33.91 
 
 
119 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123758  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38710  hypothetical protein  35.9 
 
 
118 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3299  hypothetical protein  35.04 
 
 
118 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1364  protein of unknown function DUF419  32.17 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2604  hypothetical protein  31.86 
 
 
119 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684626  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0601  protein of unknown function DUF419  35.4 
 
 
117 aa  59.3  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3032  hypothetical protein  33.04 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.747756  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1946  protein of unknown function DUF419  33.94 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2754  hypothetical protein  30.09 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1371  hypothetical protein  34.45 
 
 
123 aa  57.4  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.609964  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2917  hypothetical protein  30.09 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2864  hypothetical protein  30.97 
 
 
123 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06492  hypothetical protein  30.25 
 
 
125 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2825  hypothetical protein  30.09 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1333  hypothetical protein  33.61 
 
 
119 aa  55.1  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000163831 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04880  hypothetical protein  32.5 
 
 
124 aa  54.3  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0096  protein of unknown function DUF419  33.33 
 
 
114 aa  53.9  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.503641  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0566  hypothetical protein  31.62 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0197839  hitchhiker  0.00000289186 
 
 
-
 
NC_002950  PG1602  hypothetical protein  32.17 
 
 
126 aa  51.6  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3320  protein of unknown function DUF419  32.76 
 
 
129 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0206616  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3310  hypothetical protein  33.63 
 
 
163 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.834963 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4064  hypothetical protein  35.09 
 
 
113 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0535  hypothetical protein  30.16 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375319  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0309  hypothetical protein  34 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3944  protein of unknown function DUF419  36.14 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4443  hypothetical protein  29.66 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1077  protein of unknown function DUF419  30.89 
 
 
121 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.177675  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1379  hypothetical protein  28.07 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640185  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1903  protein of unknown function DUF419  27.35 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0411989  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6266  protein of unknown function DUF419  29.57 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2721  hypothetical protein  28.07 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1927  protein of unknown function DUF419  33.72 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0988837  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0498  hypothetical protein  26.96 
 
 
120 aa  40.8  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00553264  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3050  protein of unknown function DUF419  26.27 
 
 
122 aa  40.8  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0626  hypothetical protein  26.27 
 
 
122 aa  40.8  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00540  hypothetical protein  26.27 
 
 
122 aa  40.8  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00529  hypothetical protein  26.27 
 
 
122 aa  40.8  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0660  hypothetical protein  26.27 
 
 
122 aa  40.8  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3067  hypothetical protein  26.27 
 
 
122 aa  40.8  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62125  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0598  hypothetical protein  26.27 
 
 
122 aa  40.8  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>