116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2415 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2415  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 142 aa  275  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3134  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  72.27 
 
 		 120 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0130  anti-sigma-factor antagonist  74.58 
 
 		 118 aa  175  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3136  anti-sigma-factor antagonist  64.62 
 
 		 132 aa  173  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0981532  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0800  anti-sigma-factor antagonist  75.22 
 
 		 123 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0977014  hitchhiker  0.00820415 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2487  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  68.91 
 
 		 123 aa  168  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5230  anti-sigma-factor antagonist  67.16 
 
 		 133 aa  167  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1218  negative regulator of sigma-B  68.38 
 
 		 140 aa  167  7e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5778  anti-sigma-factor antagonist  70.18 
 
 		 125 aa  166  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2971  anti-sigma-factor antagonist  73.11 
 
 		 124 aa  165  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2117  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  67.52 
 
 		 134 aa  165  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1672  negative regulator of sigma-B  72.57 
 
 		 132 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0511  anti-sigma-factor antagonist  71.43 
 
 		 133 aa  163  9e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3340  anti-sigma-factor antagonist  71.43 
 
 		 133 aa  163  9e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3767  anti-sigma-factor antagonist  65.25 
 
 		 128 aa  161  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0691716 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1493  anti-sigma-factor antagonist  69.57 
 
 		 134 aa  160  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.423658  normal  0.0757983 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4410  anti-sigma-factor antagonist  68.1 
 
 		 124 aa  159  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2794  anti-sigma-factor antagonist  67.86 
 
 		 125 aa  153  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4971  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  69.03 
 
 		 119 aa  150  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2268  anti-sigma-factor antagonist  63.72 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3743  anti-sigma-factor antagonist  59.35 
 
 		 125 aa  143  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0475  anti-sigma-factor antagonist  58.77 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0736  anti-sigma-factor antagonist  54.03 
 
 		 134 aa  133  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0163  anti-sigma-factor antagonist  51.28 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.438455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0676  anti-sigma-factor antagonist  51.28 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.483964  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2683  anti-sigma-factor antagonist  46.34 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32010  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  46.9 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0737154  normal  0.110426 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1474  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  39.66 
 
 		 123 aa  97.4  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000611379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3858  anti-sigma-factor antagonist  54.37 
 
 		 131 aa  96.7  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3438  anti-sigma-factor antagonist  41.82 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0775335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0140  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00670241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0693  anti-sigma-factor antagonist  37.27 
 
 		 120 aa  88.6  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6566  anti-sigma-factor antagonist  37.9 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778948  normal  0.044329 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1811  anti-sigma-factor antagonist  38.89 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.01 
 
 		 272 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0196  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0995683  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3859  anti-sigma-factor antagonist  32.52 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4191  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 		 372 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  34.48 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 		 385 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  34.48 
 
 		 430 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  35.34 
 
 		 556 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 		 549 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 372 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1810  anti-sigma-factor antagonist  28.85 
 
 		 252 aa  52  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  30.11 
 
 		 323 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  29.06 
 
 		 275 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 362 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 370 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 		 357 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 		 388 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4420  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 		 271 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0141  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 		 298 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0116373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4421  anti-sigma-factor antagonist  28.44 
 
 		 271 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  28.07 
 
 		 293 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2660  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 359 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 357 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  33.72 
 
 		 667 aa  47.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  30.59 
 
 		 562 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  27.66 
 
 		 283 aa  47  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 439 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2715  anti-sigma-factor antagonist  34.04 
 
 		 341 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  31.65 
 
 		 286 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  28.44 
 
 		 291 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3768  anti-sigma-factor antagonist  29.79 
 
 		 284 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 		 371 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0116  anti-sigma-factor antagonist  35.8 
 
 		 357 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00357246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  31.2 
 
 		 523 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4192  anti-sigma-factor antagonist  27.47 
 
 		 380 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 315 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  27.38 
 
 		 421 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0799  anti-sigma-factor antagonist  26.21 
 
 		 286 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224753  hitchhiker  0.00639287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 568 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  25.56 
 
 		 312 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  29.91 
 
 		 689 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  29.55 
 
 		 445 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0963  anti-sigma-factor antagonist  29.2 
 
 		 308 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  32.18 
 
 		 290 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0129  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 		 287 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  31.51 
 
 		 361 aa  43.9  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  31.94 
 
 		 653 aa  43.9  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  30.59 
 
 		 655 aa  43.9  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  30.59 
 
 		 509 aa  43.5  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3133  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  29.27 
 
 		 283 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3137  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 283 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225193  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  30.67 
 
 		 433 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  30.86 
 
 		 388 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0512  anti-sigma-factor antagonist  26.77 
 
 		 292 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3339  anti-sigma-factor antagonist  29 
 
 		 292 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.123389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0903  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 		 376 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000110303  hitchhiker  0.00000527056 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  28.42 
 
 		 653 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4970  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  24.74 
 
 		 284 aa  42  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2486  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.59 
 
 		 294 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  26.61 
 
 		 315 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  29.41 
 
 		 653 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  26.61 
 
 		 306 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  27.68 
 
 		 361 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4325  anti-sigma-factor antagonist  29.51 
 
 		 359 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0978917  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5779  anti-sigma-factor antagonist  24.56 
 
 		 288 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>