77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4532 on replicon NC_011881
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011881  Achl_4532  copper resistance D domain protein  100 
 
 		 653 aa  1254    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.405596 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  41.54 
 
 		 718 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  41.16 
 
 		 718 aa  369  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  38.86 
 
 		 752 aa  355  1e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  41.46 
 
 		 697 aa  350  6e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  35.09 
 
 		 708 aa  264  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  35.93 
 
 		 722 aa  261  4e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  34.7 
 
 		 687 aa  258  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  37.37 
 
 		 671 aa  229  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  35.76 
 
 		 683 aa  223  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  32.22 
 
 		 739 aa  212  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  31.75 
 
 		 631 aa  211  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  31.84 
 
 		 708 aa  196  8.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  32.25 
 
 		 711 aa  195  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.14 
 
 		 675 aa  160  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  29.45 
 
 		 678 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  33.78 
 
 		 687 aa  155  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  32.44 
 
 		 731 aa  150  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  30.32 
 
 		 642 aa  150  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  29.82 
 
 		 651 aa  150  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  31.39 
 
 		 736 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  28.59 
 
 		 651 aa  147  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  28.57 
 
 		 691 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  31.52 
 
 		 664 aa  146  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  31.3 
 
 		 692 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  32.52 
 
 		 679 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  27.99 
 
 		 671 aa  140  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  30.31 
 
 		 641 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  30.31 
 
 		 641 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  28.24 
 
 		 686 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  29.23 
 
 		 646 aa  135  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  30.55 
 
 		 637 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  27.81 
 
 		 681 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  30.4 
 
 		 676 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  30.93 
 
 		 719 aa  127  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  28.69 
 
 		 665 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  28.69 
 
 		 665 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  28.62 
 
 		 665 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  27.17 
 
 		 672 aa  108  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  27.74 
 
 		 632 aa  108  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  30.43 
 
 		 651 aa  104  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  29.93 
 
 		 661 aa  91.3  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25350  putative copper export protein  29.47 
 
 		 604 aa  84  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  28.08 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.41 
 
 		 654 aa  71.6  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  28.05 
 
 		 343 aa  67  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  30.8 
 
 		 316 aa  60.1  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.35 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  29.94 
 
 		 309 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.14 
 
 		 326 aa  55.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0040  copper resistance D domain protein  32.33 
 
 		 339 aa  54.7  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  30.54 
 
 		 571 aa  50.8  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  32.12 
 
 		 551 aa  50.8  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  33.33 
 
 		 293 aa  50.4  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  30.94 
 
 		 364 aa  50.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  25.76 
 
 		 319 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  31.34 
 
 		 291 aa  48.5  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  31.34 
 
 		 291 aa  48.5  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  27.43 
 
 		 328 aa  48.1  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6631  copper resistance D domain protein  32.67 
 
 		 283 aa  47  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  31.34 
 
 		 291 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  31.34 
 
 		 291 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  28.17 
 
 		 322 aa  47  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  31.58 
 
 		 547 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  32.09 
 
 		 291 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  30.92 
 
 		 539 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3564  hypothetical protein  50.88 
 
 		 133 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  31.58 
 
 		 544 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  28.57 
 
 		 613 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  28.32 
 
 		 319 aa  44.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  33.6 
 
 		 310 aa  44.7  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  31.58 
 
 		 544 aa  44.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  31.58 
 
 		 544 aa  44.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  31.58 
 
 		 544 aa  44.3  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  37 
 
 		 588 aa  44.3  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  27.97 
 
 		 649 aa  44.3  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  31.58 
 
 		 549 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>