More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3140 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3140  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 344 aa  693    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.636128 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3340  LacI family transcription regulator  78.47 
 
 		 340 aa  538  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0794  transcriptional regulator, LacI family  56.23 
 
 		 332 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29250  transcriptional regulator  45.99 
 
 		 651 aa  276  3e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2534  transcriptional regulator, LacI family  45.43 
 
 		 663 aa  262  6e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0593  transcriptional regulator, LacI family  41.87 
 
 		 328 aa  217  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0581  Alanine racemase  41.59 
 
 		 343 aa  203  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0953116  normal  0.13709 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3013  transcriptional regulator, LacI family  40.88 
 
 		 326 aa  199  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0786  transcriptional regulator, LacI family  35.95 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1502  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.69 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.725302 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05320  transcriptional regulator  42.18 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2753  transcriptional regulator, LacI family  41.37 
 
 		 344 aa  192  9e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5102  transcriptional regulator, LacI family  39.69 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2751  transcriptional regulator, LacI family  38.14 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.360192  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0495  LacI family transcription regulator  38.37 
 
 		 354 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  36.61 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  36.87 
 
 		 333 aa  182  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0777  transcriptional regulator, LacI family  35.15 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000623929 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07090  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.72012 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  35.78 
 
 		 334 aa  179  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5165  LacI family transcription regulator  35.67 
 
 		 330 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  35.91 
 
 		 391 aa  178  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  35.45 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07200  transcriptional regulator  37.24 
 
 		 341 aa  176  5e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0947559  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  35.45 
 
 		 340 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  35.15 
 
 		 340 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  31.82 
 
 		 332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.91 
 
 		 339 aa  172  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  31.82 
 
 		 332 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  32.18 
 
 		 386 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  31.52 
 
 		 332 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3452  LacI family transcription regulator  34.22 
 
 		 369 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  31.52 
 
 		 332 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  34.74 
 
 		 340 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  31.52 
 
 		 332 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2717  LacI family transcription regulator  34.13 
 
 		 330 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  31.52 
 
 		 332 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  31.52 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4069  LacI family transcription regulator  34.12 
 
 		 367 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  35.54 
 
 		 340 aa  172  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3401  LacI family transcription regulator  34.03 
 
 		 367 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5235  LacI family transcription regulator  34.03 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3356  transcriptional regulator, LacI family  38.79 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  31.53 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  32.63 
 
 		 330 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  31.52 
 
 		 332 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.21 
 
 		 332 aa  170  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1812  LacI family transcription regulator  33.01 
 
 		 331 aa  170  4e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000564911  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  35.52 
 
 		 343 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  35.52 
 
 		 343 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  35.52 
 
 		 343 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2404  transcriptional regulator, LacI family  34.93 
 
 		 349 aa  169  8e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000976758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.63 
 
 		 332 aa  169  8e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  35.52 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  35.52 
 
 		 343 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  35.52 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  35.52 
 
 		 343 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  34.98 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  35.56 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.52 
 
 		 331 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6720  transcriptional regulator, LacI family  35.93 
 
 		 374 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  29.85 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1164  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 344 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  35.91 
 
 		 342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  32.59 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.72 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  31.16 
 
 		 346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03609  transcriptional regulator LacI family  35.37 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.34339  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  32.14 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  34.91 
 
 		 343 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2681  LacI family transcription regulator  31.61 
 
 		 335 aa  164  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  35.35 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3256  LacI family transcription regulator  35.53 
 
 		 369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.893798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  29.5 
 
 		 347 aa  163  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1631  LacI family transcription regulator  33.71 
 
 		 381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.213128  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  31.61 
 
 		 333 aa  162  6e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0329  LacI family transcription regulator  32.31 
 
 		 347 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16025  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  31.27 
 
 		 366 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0686  LacI family transcription regulator  34.23 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1905  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 355 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2238  transcriptional regulator, LacI family  34.91 
 
 		 340 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2083  LacI family transcription regulator  31.14 
 
 		 342 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  34.9 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  35.05 
 
 		 343 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.63 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  35.45 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4596  transcriptional regulator, LacI family  34.87 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0502076 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  29.64 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  30.86 
 
 		 347 aa  160  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  34.9 
 
 		 338 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  35.44 
 
 		 343 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5012  transcriptional regulator, LacI family  34.85 
 
 		 324 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0544  LacI family transcription regulator  33.66 
 
 		 335 aa  160  4e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  35.44 
 
 		 343 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  35.44 
 
 		 343 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  33.82 
 
 		 346 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5848  LacI family transcription regulator  32.27 
 
 		 365 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  34.65 
 
 		 340 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3795  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.24 
 
 		 356 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>