More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1391 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1391  Na+/solute symporter  100 
 
 
488 aa  931    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000394975 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1373  Na+/solute symporter  84.55 
 
 
498 aa  753    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6322  SSS sodium solute transporter superfamily  57.87 
 
 
499 aa  498  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.950827  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0355  Na+/solute symporter  59.32 
 
 
505 aa  482  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2131  Na+/solute symporter  58.02 
 
 
492 aa  472  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5011  Na+/solute symporter  52.75 
 
 
546 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4497  Na+/solute symporter  52.75 
 
 
546 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108837  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1155  Na+/solute symporter  54.28 
 
 
495 aa  399  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2764  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  40.59 
 
 
518 aa  276  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286695  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3375  Na+/solute symporter  58.56 
 
 
580 aa  273  5.000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3170  Na+/solute symporter  62.96 
 
 
575 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0609078  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5280  Na+/solute symporter  66.14 
 
 
573 aa  238  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135801  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2141  Na+/solute symporter  68.75 
 
 
580 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598944  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4053  Na+/solute symporter  68.42 
 
 
578 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4128  Na+/solute symporter  68.42 
 
 
578 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0931478  normal  0.469675 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4282  Na+/solute symporter  68.42 
 
 
578 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4562  Na+/solute symporter  68.79 
 
 
580 aa  232  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0697  Na+/solute symporter  64.95 
 
 
580 aa  226  7e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0069  Na+/solute symporter  50 
 
 
603 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00890  predicted symporter  54.55 
 
 
579 aa  199  9e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4131  Na+/solute symporter  49.51 
 
 
551 aa  190  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  34.2 
 
 
513 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2382  Na+/solute symporter  33.89 
 
 
528 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1063  Na+/solute symporter  50.38 
 
 
614 aa  187  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0264456  normal  0.304939 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  32.17 
 
 
516 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12120  predicted symporter  52.11 
 
 
591 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593677  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  32.64 
 
 
515 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3911  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  35.16 
 
 
554 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215473  normal  0.0942004 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  31.93 
 
 
516 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3160  SSS sodium solute transporter superfamily  34.69 
 
 
554 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261717  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  31.93 
 
 
516 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  31.93 
 
 
516 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  31.93 
 
 
516 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  31.93 
 
 
516 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  31.93 
 
 
516 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  31.7 
 
 
516 aa  183  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  31.7 
 
 
516 aa  183  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.75 
 
 
515 aa  183  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.47 
 
 
516 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2860  putative transmembrane transport protein  53.01 
 
 
562 aa  182  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00253612  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1570  Na+/solute symporter  43.44 
 
 
693 aa  182  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  32.83 
 
 
519 aa  179  8e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.77 
 
 
516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  33.96 
 
 
511 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.88 
 
 
530 aa  173  7.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  28.54 
 
 
577 aa  172  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.47 
 
 
539 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  28.71 
 
 
548 aa  171  4e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  30.74 
 
 
541 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.34 
 
 
541 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  30.54 
 
 
541 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  30.1 
 
 
553 aa  169  8e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5596  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.98 
 
 
560 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  30.61 
 
 
552 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  30.98 
 
 
552 aa  167  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  32.46 
 
 
513 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  30.52 
 
 
552 aa  166  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  31 
 
 
554 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  30.02 
 
 
559 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  30.28 
 
 
554 aa  164  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2954  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.96 
 
 
563 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6216  acetate permease  30.66 
 
 
564 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  29.87 
 
 
551 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  30.32 
 
 
554 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2787  SSS sodium solute transporter superfamily  31.59 
 
 
561 aa  163  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.59 
 
 
561 aa  163  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.868226  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  30.32 
 
 
554 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  30.32 
 
 
554 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  29.03 
 
 
551 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1277  acetate permease  29.32 
 
 
537 aa  162  1e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  31.29 
 
 
563 aa  161  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2496  SSS sodium solute transporter superfamily  31.03 
 
 
561 aa  160  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.342861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1898  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.86 
 
 
514 aa  160  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0429  acetate permease  29.8 
 
 
561 aa  160  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.839337  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  28.04 
 
 
584 aa  160  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2866  acetate permease  29.45 
 
 
666 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0150163 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2885  acetate permease  29.84 
 
 
561 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.360969  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  28.26 
 
 
584 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1577  SSS sodium solute transporter superfamily  30.25 
 
 
546 aa  159  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0392611  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.87 
 
 
659 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2260  acetate permease  29.84 
 
 
561 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.081454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2874  acetate permease  29.84 
 
 
561 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3675  hypothetical protein  30.16 
 
 
554 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.834284 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4960  Na+/solute symporter  29.7 
 
 
544 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319543  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  29.21 
 
 
552 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2791  acetate permease  29.9 
 
 
561 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.836123  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  29.65 
 
 
552 aa  157  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2929  acetate permease  29.9 
 
 
561 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984405  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  29.91 
 
 
552 aa  156  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  28.73 
 
 
584 aa  156  9e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4785  SSS sodium solute transporter superfamily  30.97 
 
 
563 aa  156  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782319  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5210  SSS sodium solute transporter superfamily  30.97 
 
 
563 aa  156  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  27.19 
 
 
665 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3837  acetate permease  28.27 
 
 
551 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0353587  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3923  acetate permease  28.27 
 
 
551 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281224  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0639  acetate permease  28.99 
 
 
571 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352767  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3949  acetate permease  28.27 
 
 
551 aa  156  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.739246 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2814  acetate permease  28.99 
 
 
571 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0455  acetate permease  28.99 
 
 
571 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1388  acetate permease  28.99 
 
 
571 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>