62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_R0060 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_R0060  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0053  tRNA-Ser  96.63 
 
 		 90 bp  153  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308091 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0008  tRNA-Ser  96.63 
 
 		 90 bp  153  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0089  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 90 bp  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0002  tRNA-Ser  92.22 
 
 		 88 bp  107  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0076  tRNA-Ser  89.66 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0062  tRNA-Ser  90.8 
 
 		 85 bp  93.7  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0066  tRNA-Ser  90.8 
 
 		 85 bp  93.7  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0007  tRNA-Ser  90.54 
 
 		 90 bp  91.7  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0010  tRNA-Ser  93.15 
 
 		 88 bp  89.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0008  tRNA-Ser  92.06 
 
 		 90 bp  85.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0007  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 87 bp  83.8  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0169683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0005  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 90 bp  77.8  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.64663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0008  tRNA-Ser  91.55 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.602453  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0007  tRNA-Ser  90.32 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0059  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.0396852 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0008  tRNA-Ser  87.84 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.497275  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0008  tRNA-Ser  87.84 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0008  tRNA-Ser  86.75 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.443501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0004  tRNA-Ser  87.1 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04530  tRNA-Ser  85.94 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303031  normal  0.07409 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0008  tRNA-Ser  85.07 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0007  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.846387  normal  0.194729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0053  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451369  hitchhiker  0.000135525 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0008  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0010  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.314795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36870  tRNA-Ser  86.49 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.339206  normal  0.059876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0029  tRNA-Ser  86.36 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23919  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0047  tRNA-Ser  88.68 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0212707  normal  0.0426305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0037  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0421417 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1364  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0030  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.849468  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14042  tRNA-Ser  84.38 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.417053 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0003  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352958  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0050  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.628519  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0056  tRNA-Ser  86.36 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133866  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0001  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00401168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0055  tRNA-Ser  86.36 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0060  tRNA-Ser  86.36 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0053  tRNA-Ser  86.36 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0980928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0008  tRNA-Ser  86.36 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0040  tRNA-Ser  85.07 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0038  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0066  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.332689 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0004  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0061  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0007  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0011  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0710717  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0009  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0008  tRNA-Ser  87.04 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02690  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 86 bp  44.1  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.599018  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0010  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.677549  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1402  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26020  tRNA-Ser  82.43 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03320  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0009  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0034  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0072  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0054  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0008  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  NMAR_2  tRNA-OTHER  100 
 
 		 124 bp  44.1  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.114787 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0009  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>