30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_R0066 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_R0066  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.332689 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0009  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.483868  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0061  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.017138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0063  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0063  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0007  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0005  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0472485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0007  tRNA-Ser  87.27 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0040  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.66072  hitchhiker  0.00010969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0004  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0005  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0036  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.122746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0062  tRNA-Ser  84.06 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0004  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.303536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03630  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187343  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0011  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0043  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0011  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000356582  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0006  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0012  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0051  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00598275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0010  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0005  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.602453  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0006  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  NMAR_2  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 124 bp  44.1  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.114787 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01840  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0026  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000000712114  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0060  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0006  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.033813  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>