162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_R0043 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0014  tRNA-Ser  85.06 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0017  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  54  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.44549  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0040  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.66072  hitchhiker  0.00010969 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt03  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.038347  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0101  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.174048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.59905e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0001  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514478  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0027  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.361674  hitchhiker  0.00190717 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0019  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.507885  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0026  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0033  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0002  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000138039  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0058  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481148  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_513  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0815  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0378889  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309077  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.537864  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNASerVIMSS1309109  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.701033  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNASerVIMSS1309153  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0009  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0526  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0061  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.388434  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0027  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNASerVIMSS1309348  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366383 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0001  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0052  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0042  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0026  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000000712114  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t17  tRNA-Ser  84.09 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0066  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.332689 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0033  tRNA-Ser  84.09 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.985807  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0034  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0006  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0004  tRNA-Ser  83.78 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0038  tRNA-Ser  84.09 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.231561  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0042  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 93 bp  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.810595  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0038  tRNA-Ser  84.09 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0018  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0028  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.411326  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0063  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26140  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4577  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309074  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNASerVIMSS1309125  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0007  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNASerVIMSS1309262  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNASerVIMSS1309150  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0061  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.017138 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0006  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0005  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0472485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0063  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0029  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124844  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.317107  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0044  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.417846 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0011  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0057  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.31512 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0026    96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0760613  normal  0.460066 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0035  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0034  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 96 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0002  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0041  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.562002  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0043  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0044  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0822  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0006  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0037  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0421417 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0032  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.945587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0009  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0314444  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0027  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0041  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.926323  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0044  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0001  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00401168  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0026  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.199991  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0052  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 96 bp  44.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0340813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0015  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.399883  normal  0.370558 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0022  tRNA-Cys  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000019175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0039  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.801401  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0054  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 95 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.582085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0049  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0051  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0044  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0050  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0567726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA21  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213698  normal  0.11304 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0020  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474391  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0008  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.109766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0047  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.740816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0050  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0163421  hitchhiker  0.00837665 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0016  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.25212  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0018  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0046  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0055  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.983952 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNASerVIMSS1309347  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233561 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0060  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0238234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0060  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0001  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000971993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>