38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_R0026 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_R0026  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000000712114  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0004  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0003  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000261436  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0014  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.232156  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0057  tRNA-Ser  90 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.570603  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0056  tRNA-Ser  90 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0079  tRNA-OTHER  100 
 
 		 121 bp  48.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0057  tRNA-Ser  90 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0055  tRNA-Ser  90 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0709169  normal  0.617884 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0027  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.361674  hitchhiker  0.00190717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0044  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00104737  normal  0.145686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0050  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0163421  hitchhiker  0.00837665 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0040  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000505544  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0007  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0052  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1206  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0042  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1162  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.520358 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1045  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.395551  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00023  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115823  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1150  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.14508  normal  0.321314 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1195  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1128  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.93394e-25 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2775  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0559618  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2147  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0226086  normal  0.478396 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0065  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0269499  hitchhiker  0.0000672663 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1336  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000172836  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1335  hypothetical protein  91.18 
 
 		 126 bp  44.1  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000192923  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0052  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000218477  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5026  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747875  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4663  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000383735  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1277  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00670593  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0042  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.760649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0041  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.985035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0059  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.98639 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0066  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.332689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>