232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1150 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1195  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1150  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.14508  normal  0.321314 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1045  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.395551  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1162  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.520358 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1128  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.93394e-25 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2147  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  176  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0226086  normal  0.478396 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1206  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  176  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4663  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  176  6e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000383735  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2775  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  176  6e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0559618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00023  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0052  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000218477  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0065  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0269499  hitchhiker  0.0000672663 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5026  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747875  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0041  tRNA-Ser  96.59 
 
 		 88 bp  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.985035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0042  tRNA-Ser  96.59 
 
 		 88 bp  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.760649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0038  tRNA-Ser  94.32 
 
 		 88 bp  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0957945 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1196  hypothetical protein  100 
 
 		 120 bp  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0043  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 88 bp  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0058  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 88 bp  107  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.345279  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0049  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 88 bp  107  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0047  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 88 bp  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.047697  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0056  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 88 bp  107  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000159077  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0038  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 88 bp  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 88 bp  87.7  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.813738  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0043  tRNA-Ser  92.19 
 
 		 88 bp  87.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0965121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0027  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 88 bp  87.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0027  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 88 bp  87.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0851644  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0054  tRNA-Ser  87.8 
 
 		 88 bp  83.8  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000530132  hitchhiker  0.00450232 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0035  tRNA-Ser  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181882  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0040  tRNA-Ser  97.78 
 
 		 88 bp  81.8  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000505544  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0526  tRNA-Ser  95.74 
 
 		 92 bp  77.8  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0021  tRNA-Ser  95.65 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.846979  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt03  tRNA-Ser  95.65 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.038347  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0043  tRNA-Ser  95.65 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0061  tRNA-Ser  97.5 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0061  tRNA-Ser  97.5 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.388434  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna25  tRNA-Ser  97.5 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000226123  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna26  tRNA-Ser  97.5 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540451  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0010  tRNA-Ser  85.23 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0027  tRNA-Ser  85.23 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.896039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0026  tRNA-Ser  85.23 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.580647  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0815  tRNA-Ser  97.5 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0378889  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0064  tRNA-Ser  95.35 
 
 		 90 bp  69.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0027  tRNA-Ser  97.44 
 
 		 90 bp  69.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0045  tRNA-Ser  95.35 
 
 		 90 bp  69.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0026    93.48 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0760613  normal  0.460066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0037  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0421417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0030  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.849468  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0022  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA21  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213698  normal  0.11304 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0051  tRNA-Ser  87.88 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0034  tRNA-Ser  95.12 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000648564  hitchhiker  0.0000599111 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0046  tRNA-Ser  95 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557666 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0007  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0060  tRNA-Ser  95 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100748  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tSer03  tRNA-Ser  97.22 
 
 		 93 bp  63.9  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000286931  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0008  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0909337  hitchhiker  0.00840657 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0032  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000241794  hitchhiker  0.000000080319 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0033  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323834  hitchhiker  0.00000000664377 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4242  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.139053  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3212  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000867673  hitchhiker  0.00385605 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0070  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0029  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0022  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000743808  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0042  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000190684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0044  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.11052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0051  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.7492  normal  0.229095 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0059  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.98639 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0003  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000261436  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.232156  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0049  tRNA-Ser  82.95 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123385 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  89.58 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3054  tRNA-Ser  89.58 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R47  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00483032  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1581  tRNA-Ser  89.58 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151315  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0040  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0721486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1226  hypothetical protein  92.5 
 
 		 99 bp  56  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0051  tRNA-Ser  82.95 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.794594  normal  0.436423 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0059  tRNA-Ser  88.24 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2605  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 92 bp  56  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164026  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0810  tRNA-Ser  89.58 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0309716  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2643  tRNA-Ser  89.58 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0059  tRNA-Ser  89.58 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2954  tRNA-Ser  89.58 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.876099  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3020  tRNA-Ser  89.58 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.419002  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1969  tRNA-Ser  89.58 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.156913  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0004  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0074  tRNA-Ser  82.95 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.982484  normal  0.493947 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1628  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 91 bp  56  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100437  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2548  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 91 bp  56  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.221952  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0072  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.789725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0038  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0065  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60250  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0085  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0078  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.412983 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0020  tRNA-Ser  89.36 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0034  tRNA-Ser  89.36 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152108  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0030  tRNA-Ser  89.36 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.993805 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0060  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276036  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>