24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01840 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01840  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0091  tRNA-Ser  93.18 
 
 		 91 bp  63.9  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000323323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0027  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0034  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.152108  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0005  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0005  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.0000142144  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0059  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.686612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.990082  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0041  tRNA-Ser  86.27 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0066  tRNA-Ser  86.27 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal  0.681656 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0020  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0057  tRNA-Ser  86.27 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0059  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0042  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000030299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0036  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.122746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0014  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000112048 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14045  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.553863  normal  0.2152 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0056  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0063  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588246  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0058  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0066  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.332689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0059  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>