36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_R0059 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_R0059  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.686612  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0036  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.122746 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0005  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 88 bp  58  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0009  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.483868  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0059  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0003  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0095  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tSer01  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.454319  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0065  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.211097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0062  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0051  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00598275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01840  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0048  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.074992  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0036  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0059  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0067  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000783692  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0084  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0117481  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0060  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100748  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0066  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.758388  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0092  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.742735  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0140  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0059  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000260642  normal  0.0200922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0049  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000491375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0118  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00112512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0105  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0580188  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0094  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000282706  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0034  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.014999  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0033  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210279  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0097  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0159037  normal  0.0335042 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0096  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.127387  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0085  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0945939  normal  0.0146717 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0023  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0068  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000566911  normal  0.0203429 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0018  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.373457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0042  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>