14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_AR0051 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_AR0051  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00598275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0012  tRNA-Ser  95.74 
 
 		 86 bp  77.8  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0066  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.332689 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0036  tRNA-Ser  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.122746 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0059  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.686612  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0003  tRNA-Ser  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.503711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0018  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0001  tRNA-Ser  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0001  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00371061 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0011  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0176232  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0069  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.980326  normal  0.628883 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0009  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.483868  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0039  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>