14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NMAR_2 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  NMAR_2  tRNA-OTHER  100 
 
 		 124 bp  246  9.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.114787 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0008  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0020  tRNA-OTHER  100 
 
 		 104 bp  61.9  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00540287 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0052  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.294271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0005  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0002  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0060  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0066  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.332689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0053  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308091 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0040  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.66072  hitchhiker  0.00010969 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0066  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>