47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_R0005 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_R0005  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0023  tRNA-Leu  91.76 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00546123  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0067  tRNA-Leu  89.19 
 
 		 85 bp  83.8  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.394732  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0021  tRNA-Leu  87.65 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.273814  normal  0.0446138 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0051  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0002  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0033  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0015  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0028  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0003  tRNA-Leu  87.67 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0002  tRNA-Leu  87.67 
 
 		 88 bp  73.8  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0001  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0025  tRNA-Leu  91.07 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.637113  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0015  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0053  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0038  tRNA-Leu  83.95 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.272303  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0006  tRNA-Leu  83.95 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0028  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0030  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0002  tRNA-Leu  83.95 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0012  tRNA-Leu  83.95 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0004  tRNA-Leu  84.72 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0554564  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0021  tRNA-Leu  85.94 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.283628  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0024  tRNA-Leu  85.29 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0039  tRNA-Leu  83.78 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0013  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0025  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0020  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.419352  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0028  tRNA-Leu  82.72 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000463035  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0043  tRNA-Asp  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383968  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0057  tRNA-Leu  83.58 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.31512 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0059  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0036  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  NMAR_2  tRNA-OTHER  93.55 
 
 		 124 bp  46.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.114787 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0042  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.810595  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0046  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0020  tRNA-OTHER  93.33 
 
 		 104 bp  44.1  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0044  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.69312  normal  0.302799 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0063  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.80963  normal  0.240218 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0054  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0040  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471615  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0015  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 67 bp  44.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0082796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0031  tRNA-Leu  82.35 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0027  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0044  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0028  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>