7 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_R0003 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00540287 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0008  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 88 bp  89.7  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0020  tRNA-OTHER  100 
 
 		 104 bp  52  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  NMAR_2  tRNA-OTHER  100 
 
 		 124 bp  50.1  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.114787 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0025  tRNA-Leu  83.1 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0052  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.294271  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>