9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_R0020 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_R0020  tRNA-OTHER  100 
 
 		 104 bp  206  8e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  NMAR_2  tRNA-OTHER  100 
 
 		 124 bp  61.9  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.114787 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0008  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00540287 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0040  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0051  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  46.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.267767  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0052  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.294271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0005  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>