41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_R0008 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_R0008  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0003  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00540287 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0054  tRNA-Leu  84.81 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000221727  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  NMAR_2  tRNA-OTHER  97.14 
 
 		 124 bp  61.9  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.114787 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0020  tRNA-OTHER  96.77 
 
 		 104 bp  54  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0016  tRNA-Leu  84 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0015  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0002  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0042  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.552525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0020  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0005  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.936331 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0007  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0422761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0009  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0342668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0020  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.311496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0028  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.491326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0046  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0016  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000058475 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0022  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00069315 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0019  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.307428  hitchhiker  0.00000285444 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0024  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0034  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0444691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0016  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0019  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000026789 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0032  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0052  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.294271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0505  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  96.43 
 
 		 516 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.219397 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0018  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.424159  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0031  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0003  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0023  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.248338  normal  0.650257 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0066  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0053  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308091 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0002  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0016  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0011  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0006  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0582006 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0005  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0041  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.415053 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0035  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.563034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0060  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>