15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_R0054 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000221727  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0010  tRNA-Leu  95.29 
 
 		 85 bp  137  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.76592 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0002  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 88 bp  87.7  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0001  tRNA-Leu  89.04 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0002  tRNA-Leu  89.04 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0003  tRNA-Leu  87.65 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0060  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.475799  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0008  tRNA-Leu  84.81 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0057  tRNA-Leu  82.35 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.31512 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0058  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0282229  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0016  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.875274  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0028  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0030  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0053  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0041  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>