36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_AR0001 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_AR0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0001  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0021  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.273814  normal  0.0446138 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0003  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0002  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 88 bp  113  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0028  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0030  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0002  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0012  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0038  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.272303  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0060  tRNA-Leu  91.78 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.475799  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0028  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0025  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 88 bp  89.7  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0033  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0006  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0015  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0054  tRNA-Leu  89.04 
 
 		 88 bp  81.8  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000221727  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0053  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0010  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.76592 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0024  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0005  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0015  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0052  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.290832  normal  0.159896 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0023  tRNA-Leu  83.95 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00546123  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0058  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0282229  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0044  tRNA-Leu  82.35 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0016  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.875274  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0013  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.348243  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0057  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.31512 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0067  tRNA-Leu  82.35 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.394732  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0056  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0017  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0042  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.810595  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0045  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.169896 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>