18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_AR0058 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_AR0058  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0282229  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0057  tRNA-Leu  92.94 
 
 		 85 bp  121  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.31512 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0016  tRNA-Leu  89.33 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.875274  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0018  tRNA-Leu  95.74 
 
 		 84 bp  77.8  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0017  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0002  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0030  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0028  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0001  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0028  tRNA-Leu  84 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000463035  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0054  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000221727  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0060  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.475799  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0018  tRNA-Leu  84.75 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.424159  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0025  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0003  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0002  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0053  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0032  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>