28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0028 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000463035  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0067  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.394732  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0023  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00546123  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0017  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0013  tRNA-Leu  88.16 
 
 		 85 bp  79.8  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0018  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 84 bp  73.8  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0020  tRNA-Leu  91.23 
 
 		 84 bp  73.8  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.419352  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0010  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169378  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0048  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00301923  normal  0.303873 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0057  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.31512 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0036  tRNA-Leu  83.95 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0038  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.272303  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0012  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0002  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0015  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.875274  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0058  tRNA-Leu  84 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0282229  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0059  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0025  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0033  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0021  tRNA-Leu  82.35 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.273814  normal  0.0446138 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0005  tRNA-Leu  82.72 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0027  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0037  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 83 bp  50.1  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0063  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199117  hitchhiker  0.00257733 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0028  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0044  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0044  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>