88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_R0017 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_R0017  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0057  tRNA-Leu  88.24 
 
 
85 bp  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.31512 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0027  tRNA-Leu  88.24 
 
 
85 bp  89.7  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.319132  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0054  tRNA-Leu  88.24 
 
 
84 bp  81.8  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0028  tRNA-Leu  87.06 
 
 
85 bp  81.8  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000463035  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0058  tRNA-Leu  85.88 
 
 
85 bp  73.8  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0282229  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0019  tRNA-Leu  87.06 
 
 
84 bp  73.8  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0046  tRNA-Leu  85.88 
 
 
84 bp  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0049  tRNA-Leu  85.88 
 
 
84 bp  65.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.256448  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0044  tRNA-Leu  85.88 
 
 
84 bp  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0018  tRNA-Leu  91.67 
 
 
84 bp  63.9  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0016  tRNA-Leu  86.76 
 
 
83 bp  63.9  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.454165  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0014  tRNA-Leu  84.71 
 
 
83 bp  60  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.992172  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0013  tRNA-Leu  92.5 
 
 
85 bp  56  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0018  tRNA-Leu  85.07 
 
 
85 bp  54  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.424159  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0015  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  54  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.399883  normal  0.370558 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0013  tRNA-Leu  84.29 
 
 
85 bp  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0037  tRNA-Leu  91.11 
 
 
83 bp  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0066  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0010  tRNA-Leu  82.35 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169378  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0067  tRNA-Leu  82.35 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.394732  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNASerVIMSS1309347  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233561 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0072  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.789725  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0001  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0085  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0060  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276036  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA21  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213698  normal  0.11304 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNASerVIMSS1309348  tRNA-Ser  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00366383 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0078  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.412983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0055  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.983952 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0065  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0022  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0028  tRNA-Leu  93.55 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0062  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2408  normal  0.378741 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0030  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.305018  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNASerVIMSS1309256  tRNA-Ser  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123875 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0026    100 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0760613  normal  0.460066 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0101  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.174048  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0030  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.849468  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0037  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0421417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0040  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0058  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481148  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0018  tRNA-OTHER  85.19 
 
 
83 bp  44.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0046  tRNA-Leu  83.87 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.26124 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0018  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.023039  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0051  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0046  tRNA-Leu  82.86 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_513  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.507885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0001  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514478  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0003  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352958  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0042  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0048  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0319872  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0027  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0002  tRNA-Ser  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309077  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.537864  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0815  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0378889  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0044  tRNA-Ser  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0041  tRNA-Ser  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.926323  normal  0.128677 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0822  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0002  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  44.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000138039  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0033  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0026  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNASerVIMSS1309109  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.701033  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0019  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.59905e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4306  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0002  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0001  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt03  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.038347  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0009  tRNA-Leu  83.33 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNASerVIMSS1309192  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0006  tRNA-Leu  93.33 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0070  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNASerVIMSS1309153  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0021  tRNA-Leu  83.33 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0028  tRNA-Leu  96.15 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0009  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0526  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  44.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  44.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179868  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0036  tRNA-Leu  83.33 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.872291  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0040  tRNA-Leu  83.33 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.425514  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0061  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.388434  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.44549  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0046  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.557666 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0027  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  44.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>