58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_R0018 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_R0018  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.424159  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0016  tRNA-Leu  91.76 
 
 		 88 bp  113  7.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000058475 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0009  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 88 bp  105  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0342668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0032  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0016  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 88 bp  89.7  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0005  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 88 bp  89.7  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.936331 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0035  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.563034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0007  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 88 bp  89.7  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0422761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0019  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000026789 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0011  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0028  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 88 bp  81.8  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0022  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 88 bp  73.8  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00069315 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0024  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 88 bp  73.8  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0023  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.248338  normal  0.650257 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0020  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0042  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.552525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0016  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0006  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0582006 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0046  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0041  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.415053 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0016  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0019  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.307428  hitchhiker  0.00000285444 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0020  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.311496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0028  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.491326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0034  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 88 bp  69.9  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0444691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0005  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0057  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.31512 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0017  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0010  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169378  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0014  tRNA-Leu  82.35 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0477043 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0035  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0001  tRNA-Leu  82.35 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.919752  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0505  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  100 
 
 		 516 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.219397 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0008  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0021  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.283628  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0040  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.66072  hitchhiker  0.00010969 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0052  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.294271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0058  tRNA-Leu  84.75 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0282229  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0049  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00365867  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0001  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00148219  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0006  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 97 bp  46.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.16425 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0013  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0035  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0049  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000106187  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0004  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0001  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.223557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0018  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0150168  hitchhiker  0.0000162071 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0031  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.334076  hitchhiker  0.00102641 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0010  tRNA-OTHER  100 
 
 		 103 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262491 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0043  tRNA-OTHER  100 
 
 		 102 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.049603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0030  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0014  tRNA-Ser  100 
 
 		 98 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0021  tRNA-Ser  100 
 
 		 104 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.595381 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0008  tRNA-OTHER  100 
 
 		 110 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.245868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0036  tRNA-Arg  100 
 
 		 123 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0876357 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0027  tRNA-OTHER  100 
 
 		 100 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 98 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>