32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_R0030 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0021  tRNA-Leu  91.76 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.273814  normal  0.0446138 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0003  tRNA-Leu  93.24 
 
 		 85 bp  107  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0002  tRNA-Leu  93.24 
 
 		 88 bp  107  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0001  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0024  tRNA-Leu  96.72 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0028  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0002  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0060  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.475799  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0038  tRNA-Leu  90.41 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.272303  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0012  tRNA-Leu  90.41 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0002  tRNA-Leu  90.41 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0033  tRNA-Leu  89.86 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0052  tRNA-Leu  87.67 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.290832  normal  0.159896 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0006  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0044  tRNA-Leu  87.67 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0053  tRNA-Leu  87.67 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0015  tRNA-Leu  90.16 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0025  tRNA-Leu  86.3 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0005  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0058  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0282229  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0010  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.010804  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0018  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0054  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000221727  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0056  tRNA-Leu  85.25 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0010  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.76592 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0023  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00546123  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0048  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00301923  normal  0.303873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0957945 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0042  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.813738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>