17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_AR0060 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_AR0060  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.475799  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0002  tRNA-Leu  91.78 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0001  tRNA-Leu  91.78 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0030  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0028  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0024  tRNA-Leu  93.44 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0002  tRNA-Leu  88.61 
 
 		 88 bp  85.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0003  tRNA-Leu  88.61 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0025  tRNA-Leu  89.04 
 
 		 88 bp  81.8  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0010  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.76592 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0054  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000221727  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0028  tRNA-Leu  86.3 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0053  tRNA-Leu  85.33 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0021  tRNA-Leu  84.93 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.273814  normal  0.0446138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0058  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0282229  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0044  tRNA-Leu  85 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0052  tRNA-Leu  82.67 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.290832  normal  0.159896 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>