19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0052 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0052  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.290832  normal  0.159896 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0053  tRNA-Leu  95.29 
 
 		 85 bp  137  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0056  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0028  tRNA-Leu  87.67 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0030  tRNA-Leu  87.67 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0002  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0001  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0002  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0003  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0021  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.273814  normal  0.0446138 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0051  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0038  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.272303  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0002  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0012  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0010  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.010804  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0024  tRNA-Leu  85.25 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0010  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.76592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0060  tRNA-Leu  82.67 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.475799  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0023  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00546123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>