25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_R0010 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_R0010  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.010804  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0024  tRNA-Leu  90.28 
 
 		 85 bp  87.7  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0013  tRNA-Leu  89.71 
 
 		 85 bp  79.8  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.348243  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0025  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.637113  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0039  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0028  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0030  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0048  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0319872  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0045  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.459073 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0007  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.375919  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0004  tRNA-Leu  84.06 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0554564  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0015  tRNA-Leu  84.06 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0052  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.290832  normal  0.159896 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0044  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0053  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0042  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0046  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0051  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0013  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0018  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.023039  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0023  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00546123  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0041  tRNA-Leu  86.27 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0026  tRNA-Cys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0051  tRNA-Leu  82.43 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0065  tRNA-Cys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.877098  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>