38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_R0002 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.272303  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0012  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0033  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  137  5e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0015  tRNA-Leu  95.29 
 
 		 85 bp  137  5e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0021  tRNA-Leu  91.76 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.273814  normal  0.0446138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0002  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0025  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 88 bp  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0001  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0002  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 88 bp  89.7  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0003  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0030  tRNA-Leu  90.41 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0028  tRNA-Leu  90.41 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0048  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 84 bp  81.8  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00301923  normal  0.303873 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0024  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0006  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0044  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0028  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0053  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0023  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00546123  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0067  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.394732  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0015  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0028  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000463035  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0005  tRNA-Leu  83.95 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0052  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.290832  normal  0.159896 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0013  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0046  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.26124 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0051  tRNA-Leu  82.72 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0056  tRNA-Leu  82.35 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0063  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199117  hitchhiker  0.00257733 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.875274  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0018  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0046  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2089  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.835616  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0023  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0167  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1831  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.399609  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1765  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.393275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>