39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_R0051 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0005  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0023  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00546123  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0031  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 83 bp  67.9  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0033  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0015  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0004  tRNA-Leu  87.72 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0554564  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0052  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.290832  normal  0.159896 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0025  tRNA-Leu  87.72 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.637113  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0024  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000583743  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0038  tRNA-Leu  82.72 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.272303  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0012  tRNA-Leu  82.72 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0002  tRNA-Leu  82.72 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0020  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.419352  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0026  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000484492  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0013  tRNA-Asp  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00001857  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0006  tRNA-Asp  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.217268  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0049  tRNA-Asp  91.67 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000144265  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0067  tRNA-Leu  83.58 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.394732  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0048  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000333522  normal  0.379894 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0033  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.228268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0010  tRNA-Leu  82.43 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.010804  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.453566  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_757  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0984996  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0035  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.724762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0007  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198503  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0025  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0005  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281079  normal  0.0361726 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0024  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.854506  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0048  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0106217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0010  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0036  tRNA-Asp  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00224003  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0048  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.950011  normal  0.193267 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0040  tRNA-Asp  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00699414  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0030  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0006  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0048  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863907  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0010  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>