22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_R0018 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_R0018  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0058  tRNA-Leu  95.74 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0282229  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0028  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000463035  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0017  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0016  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.875274  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0028  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0021  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.273814  normal  0.0446138 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0067  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.394732  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0048  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00301923  normal  0.303873 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0030  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0028  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0006  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0012  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.272303  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0023  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00546123  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0027  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0048  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0319872  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0042  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0051  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0013  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0018  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.023039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>