56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_R0022 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00069315 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0034  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 88 bp  159  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0444691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0024  tRNA-Leu  97.73 
 
 		 88 bp  159  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0020  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 88 bp  127  5e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0028  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 88 bp  127  5e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.491326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0019  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 88 bp  127  5e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.307428  hitchhiker  0.00000285444 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0016  tRNA-Leu  92.94 
 
 		 85 bp  121  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0020  tRNA-Leu  92.05 
 
 		 88 bp  119  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.311496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0042  tRNA-Leu  92.05 
 
 		 88 bp  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.552525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0009  tRNA-Leu  92.05 
 
 		 88 bp  119  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0342668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0016  tRNA-Leu  92.05 
 
 		 88 bp  119  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000058475 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0046  tRNA-Leu  92.05 
 
 		 88 bp  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0016  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 88 bp  117  5e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0041  tRNA-Leu  91.76 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.415053 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0023  tRNA-Leu  91.76 
 
 		 88 bp  113  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.248338  normal  0.650257 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0006  tRNA-Leu  91.76 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0582006 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0005  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0016  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 88 bp  95.6  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0019  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000026789 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0032  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0007  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 88 bp  87.7  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0422761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0005  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 88 bp  87.7  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.936331 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0028  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 88 bp  85.7  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0035  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.563034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0023  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 88 bp  79.8  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0018  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.424159  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0001  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.919752  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0011  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0041  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0014  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0477043 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0032  tRNA-Leu  84.09 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0034  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 100 bp  58  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0006  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 97 bp  58  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.16425 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0034  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0505  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  100 
 
 		 516 bp  56  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.219397 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0041  tRNA-OTHER  96.67 
 
 		 100 bp  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0008  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0035  tRNA-Leu  82.35 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0025  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0008  tRNA-OTHER  100 
 
 		 110 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.245868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0021  tRNA-Ser  100 
 
 		 104 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.595381 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0030  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0043  tRNA-OTHER  100 
 
 		 102 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.049603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0011  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.371979  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0018  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0150168  hitchhiker  0.0000162071 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0010  tRNA-OTHER  100 
 
 		 103 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262491 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0036  tRNA-Arg  100 
 
 		 123 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0876357 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 98 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0014  tRNA-Ser  100 
 
 		 98 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0031  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.334076  hitchhiker  0.00102641 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0027  tRNA-OTHER  100 
 
 		 100 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0049  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00365867  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0035  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0049  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000106187  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0040  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.66072  hitchhiker  0.00010969 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>