54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_R0020 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_R0042  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.552525  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.311496  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.415053 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0020  tRNA-Leu  98.86 
 
 
88 bp  167  5e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0028  tRNA-Leu  98.86 
 
 
88 bp  167  5e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.491326  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0019  tRNA-Leu  98.86 
 
 
88 bp  167  5e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.307428  hitchhiker  0.00000285444 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0046  tRNA-Leu  98.86 
 
 
88 bp  167  5e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0016  tRNA-Leu  98.85 
 
 
88 bp  165  2.0000000000000002e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0005  tRNA-Leu  98.82 
 
 
85 bp  161  3e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0023  tRNA-Leu  98.82 
 
 
88 bp  161  3e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.248338  normal  0.650257 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0016  tRNA-Leu  98.82 
 
 
85 bp  161  3e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0006  tRNA-Leu  98.82 
 
 
85 bp  161  3e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0582006 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0016  tRNA-Leu  95.45 
 
 
88 bp  143  8e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0007  tRNA-Leu  95.45 
 
 
88 bp  143  8e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0422761  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0005  tRNA-Leu  95.45 
 
 
88 bp  143  8e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.936331 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0035  tRNA-Leu  95.29 
 
 
85 bp  137  5e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.563034  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0019  tRNA-Leu  95.29 
 
 
85 bp  137  5e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000026789 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0032  tRNA-Leu  95.29 
 
 
85 bp  137  5e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0028  tRNA-Leu  94.25 
 
 
88 bp  133  7.999999999999999e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0011  tRNA-Leu  94.12 
 
 
85 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0034  tRNA-Leu  93.18 
 
 
88 bp  127  5e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0444691  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0024  tRNA-Leu  92.05 
 
 
88 bp  119  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0022  tRNA-Leu  92.05 
 
 
88 bp  119  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00069315 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0009  tRNA-Leu  88.64 
 
 
88 bp  95.6  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0342668  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0016  tRNA-Leu  89.89 
 
 
88 bp  89.7  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000058475 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0018  tRNA-Leu  97.5 
 
 
85 bp  71.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.424159  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0505  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  100 
 
 
516 bp  56  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.219397 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0041  tRNA-Leu  87.36 
 
 
85 bp  54  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0008  tRNA-Leu  96.55 
 
 
88 bp  50.1  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0035  tRNA-Leu  82.35 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0041  tRNA-OTHER  96.55 
 
 
100 bp  50.1  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0014  tRNA-Leu  82.35 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0477043 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0034  tRNA-Leu  96.55 
 
 
100 bp  50.1  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0023  tRNA-Leu  96.55 
 
 
88 bp  50.1  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0006  tRNA-Leu  96.55 
 
 
97 bp  50.1  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.16425 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0034  tRNA-Leu  82.35 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0025  tRNA-Leu  96.43 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0036  tRNA-Arg  100 
 
 
123 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0876357 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0011  tRNA-Thr  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.371979  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0043  tRNA-OTHER  100 
 
 
102 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.049603  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0030  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0018  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0150168  hitchhiker  0.0000162071 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0021  tRNA-Ser  100 
 
 
104 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.595381 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0008  tRNA-OTHER  100 
 
 
110 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.245868  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 
98 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0014  tRNA-Ser  100 
 
 
98 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0027  tRNA-OTHER  100 
 
 
100 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0010  tRNA-OTHER  100 
 
 
103 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.262491 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0031  tRNA-Ser  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.334076  hitchhiker  0.00102641 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0035  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0049  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00365867  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0049  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000106187  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0040  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.66072  hitchhiker  0.00010969 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>