48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_R0007 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0018  tRNA-Ser  97.65 
 
 		 88 bp  153  8e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0150168  hitchhiker  0.0000162071 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0031  tRNA-Ser  97.65 
 
 		 85 bp  153  8e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.334076  hitchhiker  0.00102641 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0030  tRNA-Ser  97.65 
 
 		 88 bp  153  8e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0014  tRNA-Ser  100 
 
 		 98 bp  61.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0010  tRNA-OTHER  100 
 
 		 103 bp  61.9  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262491 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0027  tRNA-OTHER  100 
 
 		 100 bp  61.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0008  tRNA-OTHER  100 
 
 		 110 bp  61.9  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.245868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 98 bp  61.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0036  tRNA-Arg  100 
 
 		 123 bp  61.9  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0876357 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0043  tRNA-OTHER  100 
 
 		 102 bp  61.9  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.049603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0021  tRNA-Ser  100 
 
 		 104 bp  61.9  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.595381 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0014  tRNA-Ser  84.88 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00454198  hitchhiker  6.07507e-16 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0031  tRNA-Ser  84.71 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.137848  normal  0.0108409 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0009  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0342668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.311496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000058475 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00069315 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0014  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 96 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000019033  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0444691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0049  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00365867  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0007  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0422761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0049  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000106187  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.491326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0035  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.307428  hitchhiker  0.00000285444 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.563034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.415053 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0005  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0006  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0582006 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000026789 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0005  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.936331 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.248338  normal  0.650257 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0042  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.552525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0033  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 100 bp  46.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0033  tRNA-Ser  82.56 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0011  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.371979  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0008  tRNA-Lys  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0194876  normal  0.882608 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0040  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.66072  hitchhiker  0.00010969 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0018  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.424159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>