32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_R0034 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 100 bp  198  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0001  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  87.7  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.919752  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0006  tRNA-Leu  86 
 
 		 97 bp  83.8  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.16425 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  81.8  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000058475 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0009  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 88 bp  73.8  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0342668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0032  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0034  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0444691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0024  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0022  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00069315 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0032  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  56  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0028  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 88 bp  56  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0019  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  56  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000026789 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0016  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 88 bp  56  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0023  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 88 bp  56  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0020  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0023  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.248338  normal  0.650257 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0006  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0582006 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0042  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.552525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0005  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0016  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0028  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.491326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0020  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.311496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0016  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0046  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0041  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.415053 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0019  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.307428  hitchhiker  0.00000285444 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0035  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0025  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 96 bp  48.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0041  tRNA-OTHER  93.33 
 
 		 100 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0034  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0014  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0477043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>