28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_R0032 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0023  tRNA-Leu  95.45 
 
 
88 bp  143  8e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0001  tRNA-Leu  94.12 
 
 
85 bp  129  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.919752  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0041  tRNA-Leu  90.59 
 
 
85 bp  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0014  tRNA-Leu  88.24 
 
 
85 bp  89.7  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0477043 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0016  tRNA-Leu  86.36 
 
 
88 bp  79.8  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000058475 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0009  tRNA-Leu  85.23 
 
 
88 bp  71.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0342668  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0034  tRNA-Leu  84.71 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0022  tRNA-Leu  84.09 
 
 
88 bp  63.9  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00069315 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0024  tRNA-Leu  84.09 
 
 
88 bp  63.9  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0034  tRNA-Leu  93.18 
 
 
100 bp  63.9  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0035  tRNA-Leu  83.53 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0034  tRNA-Leu  82.95 
 
 
88 bp  56  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0444691  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0028  tRNA-Leu  82.76 
 
 
88 bp  54  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0006  tRNA-Leu  92.11 
 
 
97 bp  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.16425 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0041  tRNA-OTHER  96.67 
 
 
100 bp  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0012  tRNA-Met  96.55 
 
 
79 bp  50.1  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0016  tRNA-Leu  81.82 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0046  tRNA-Leu  81.82 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0030  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0029  tRNA-OTHER  100 
 
 
117 bp  48.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0018  tRNA-OTHER  100 
 
 
110 bp  48.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0016  tRNA-Leu  81.61 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0031  tRNA-Gly  96.15 
 
 
92 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0029  tRNA-Gly  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0015  tRNA-Gly  96.15 
 
 
91 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123591 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0025  tRNA-OTHER  96.15 
 
 
108 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0020  tRNA-Gly  96.15 
 
 
94 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000277692 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>