20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_R0001 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_R0001  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.919752  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0032  tRNA-Leu  94.12 
 
 
88 bp  129  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0041  tRNA-Leu  92.94 
 
 
85 bp  121  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0023  tRNA-Leu  92.94 
 
 
88 bp  121  3e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0014  tRNA-Leu  90.59 
 
 
85 bp  105  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0477043 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 
100 bp  87.7  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0009  tRNA-Leu  85.88 
 
 
88 bp  73.8  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0342668  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0016  tRNA-Leu  85.88 
 
 
88 bp  73.8  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000058475 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0022  tRNA-Leu  85.88 
 
 
88 bp  73.8  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00069315 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0035  tRNA-Leu  84.71 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0034  tRNA-Leu  84.71 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0024  tRNA-Leu  83.53 
 
 
88 bp  58  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0034  tRNA-Leu  83.53 
 
 
88 bp  58  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0444691  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0041  tRNA-OTHER  96.67 
 
 
100 bp  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0019  tRNA-Leu  82.35 
 
 
88 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.307428  hitchhiker  0.00000285444 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0016  tRNA-Leu  82.35 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0020  tRNA-Leu  82.35 
 
 
88 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0028  tRNA-Leu  82.35 
 
 
88 bp  50.1  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.491326  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0018  tRNA-Leu  82.35 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.424159  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0006  tRNA-Leu  91.67 
 
 
97 bp  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.16425 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>