34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_R0041 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0001  tRNA-Leu  92.94 
 
 
85 bp  121  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.919752  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0035  tRNA-Leu  90.59 
 
 
85 bp  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0032  tRNA-Leu  90.59 
 
 
88 bp  105  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0034  tRNA-Leu  90.59 
 
 
85 bp  105  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0023  tRNA-Leu  88.24 
 
 
88 bp  89.7  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 
100 bp  81.8  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0024  tRNA-Leu  85.88 
 
 
88 bp  73.8  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0022  tRNA-Leu  85.88 
 
 
88 bp  73.8  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00069315 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0034  tRNA-Leu  84.71 
 
 
88 bp  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0444691  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0014  tRNA-Leu  84.71 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0477043 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0041  tRNA-OTHER  97.22 
 
 
100 bp  63.9  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0032  tRNA-Leu  86.05 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0016  tRNA-Leu  86.05 
 
 
88 bp  60  0.00000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0023  tRNA-Leu  86.05 
 
 
88 bp  60  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.248338  normal  0.650257 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0016  tRNA-Leu  86.05 
 
 
88 bp  60  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0019  tRNA-Leu  86.05 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000026789 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0006  tRNA-Leu  86.05 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0582006 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0046  tRNA-Leu  86.05 
 
 
88 bp  60  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0016  tRNA-Leu  83.53 
 
 
88 bp  58  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000058475 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0020  tRNA-Leu  87.36 
 
 
88 bp  54  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0028  tRNA-Leu  87.36 
 
 
88 bp  54  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.491326  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0020  tRNA-Leu  87.36 
 
 
88 bp  54  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.311496  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0019  tRNA-Leu  87.36 
 
 
88 bp  54  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.307428  hitchhiker  0.00000285444 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0041  tRNA-Leu  87.36 
 
 
85 bp  54  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.415053 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0005  tRNA-Leu  87.36 
 
 
85 bp  54  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0016  tRNA-Leu  87.36 
 
 
85 bp  54  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0042  tRNA-Leu  87.36 
 
 
88 bp  54  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.552525  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0028  tRNA-Leu  84.88 
 
 
88 bp  52  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0009  tRNA-Leu  82.35 
 
 
88 bp  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0342668  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0006  tRNA-Leu  93.55 
 
 
97 bp  46.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.16425 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0035  tRNA-Leu  83.72 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.563034  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0007  tRNA-Leu  83.72 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0422761  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0005  tRNA-Leu  83.72 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.936331 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>