41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_R0041 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_R0041  tRNA-OTHER  100 
 
 		 100 bp  198  2.0000000000000003e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0477043 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0035  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0041  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0006  tRNA-Leu  95 
 
 		 97 bp  63.9  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.16425 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  60  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0001  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.919752  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0026  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  52  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0032  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0003  tRNA-Ser  100 
 
 		 96 bp  52  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0022  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00069315 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0016  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0028  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0042  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.552525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0023  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.248338  normal  0.650257 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0020  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.311496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0028  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.491326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0032  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0020  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0019  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000026789 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0016  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0016  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0006  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0582006 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0005  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0046  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0041  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.415053 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0019  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.307428  hitchhiker  0.00000285444 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0005  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.936331 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0016  tRNA-Ser  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0007  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0422761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0034  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0444691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0024  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0016  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000058475 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0009  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0342668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0035  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.563034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  MSED_t10  tRNA-Ser  100 
 
 		 109 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.236115 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0002  tRNA-OTHER  100 
 
 		 96 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000357273  normal  0.26313 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0045  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00820009  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0034  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 100 bp  44.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  MSED_0  tRNA-OTHER  100 
 
 		 112 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.674515  normal  0.0251104 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>