40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_R0023 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0032  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 88 bp  143  8e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0001  tRNA-Leu  92.94 
 
 		 85 bp  121  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.919752  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0014  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0477043 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0041  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0009  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 88 bp  79.8  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0342668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0022  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 88 bp  79.8  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00069315 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0016  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 88 bp  79.8  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000058475 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0034  tRNA-Leu  84.09 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0444691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0024  tRNA-Leu  84.09 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0041  tRNA-OTHER  100 
 
 		 100 bp  60  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0034  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0034  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 100 bp  56  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0020  tRNA-Leu  82.95 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0006  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 97 bp  56  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.16425 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0019  tRNA-Leu  82.95 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.307428  hitchhiker  0.00000285444 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0028  tRNA-Leu  82.95 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.491326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0028  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0035  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0016  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0020  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.311496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0042  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.552525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0032  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0005  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0012  tRNA-Met  96.55 
 
 		 79 bp  50.1  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0016  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0041  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.415053 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0046  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0023  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.248338  normal  0.650257 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0006  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0582006 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0016  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0019  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000026789 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0030  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0029  tRNA-OTHER  100 
 
 		 117 bp  48.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0018  tRNA-OTHER  100 
 
 		 110 bp  48.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0020  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000277692 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0025  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 108 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0015  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123591 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0031  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0029  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.320757 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>