25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_R0030 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_R0030  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0029  tRNA-OTHER  100 
 
 		 117 bp  83.8  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0003  tRNA-OTHER  94.34 
 
 		 103 bp  81.8  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0822351  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0018  tRNA-OTHER  97.78 
 
 		 110 bp  81.8  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0029  tRNA-Ser  86.36 
 
 		 88 bp  79.8  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0017  tRNA-Ser  86.36 
 
 		 88 bp  79.8  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544015  hitchhiker  0.0000175042 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0033  tRNA-Ser  85.56 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0030  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 101 bp  58  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.329697  hitchhiker  0.00107888 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0025  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0014  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00454198  hitchhiker  6.07507e-16 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0016  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0002  tRNA-OTHER  92.31 
 
 		 96 bp  54  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000357273  normal  0.26313 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0012  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  50.1  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0003  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 96 bp  50.1  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0010  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 130 bp  50.1  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0008  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 110 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.245868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0031  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.137848  normal  0.0108409 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0043  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 102 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.049603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0010  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 103 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262491 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0027  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 100 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0014  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 98 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0008  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 98 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0036  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 123 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0876357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>