24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_R0035 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0034  tRNA-Leu  91.76 
 
 
85 bp  113  7.000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0041  tRNA-Leu  90.59 
 
 
85 bp  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0014  tRNA-Leu  87.06 
 
 
85 bp  81.8  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0477043 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0041  tRNA-OTHER  97.5 
 
 
100 bp  71.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.233202 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0001  tRNA-Leu  84.71 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.919752  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0032  tRNA-Leu  83.53 
 
 
88 bp  58  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0023  tRNA-Leu  96.67 
 
 
88 bp  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0018  tRNA-Leu  93.94 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.424159  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0020  tRNA-Leu  82.35 
 
 
88 bp  50.1  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.311496  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0034  tRNA-Leu  82.35 
 
 
88 bp  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0444691  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0022  tRNA-Leu  82.35 
 
 
88 bp  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00069315 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0041  tRNA-Leu  82.35 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.415053 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0005  tRNA-Leu  82.35 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0042  tRNA-Leu  82.35 
 
 
88 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.552525  normal 
 
 
-
 
NC_009440  MSED_0  tRNA-OTHER  100 
 
 
112 bp  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.674515  normal  0.0251104 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0034  tRNA-Leu  90 
 
 
100 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0045  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00820009  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0026  tRNA-Ser  96.3 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0006  tRNA-Leu  96.15 
 
 
97 bp  44.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.16425 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0003  tRNA-Ser  100 
 
 
96 bp  44.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0002  tRNA-OTHER  100 
 
 
96 bp  44.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000357273  normal  0.26313 
 
 
-
 
NC_009440  MSED_t10  tRNA-Ser  100 
 
 
109 bp  44.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.236115 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0016  tRNA-Ser  100 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>