14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MSED_0 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  MSED_0  tRNA-OTHER  100 
 
 		 112 bp  222  9.999999999999999e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.674515  normal  0.0251104 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0012  tRNA-OTHER  86.21 
 
 		 114 bp  89.7  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0016  tRNA-Ser  100 
 
 		 84 bp  50.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0026  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0002  tRNA-OTHER  100 
 
 		 96 bp  50.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000357273  normal  0.26313 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0003  tRNA-Ser  100 
 
 		 96 bp  50.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_009440  MSED_t10  tRNA-Ser  100 
 
 		 109 bp  50.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.236115 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0045  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00820009  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0021  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 104 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.595381 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0477043 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0041  tRNA-OTHER  100 
 
 		 100 bp  44.1  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>