14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_R0003 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_R0003  tRNA-Ser  100 
 
 		 96 bp  190  4e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0002  tRNA-OTHER  87.5 
 
 		 96 bp  95.6  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000357273  normal  0.26313 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0016  tRNA-Ser  95.12 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0026  tRNA-Ser  95.12 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0477043 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0041  tRNA-OTHER  100 
 
 		 100 bp  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_009440  MSED_t10  tRNA-Ser  100 
 
 		 109 bp  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.236115 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0030  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 88 bp  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  MSED_0  tRNA-OTHER  100 
 
 		 112 bp  50.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.674515  normal  0.0251104 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0045  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00820009  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0005  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0006  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 97 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.16425 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>