59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_R0008 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_R0008  tRNA-OTHER  100 
 
 		 110 bp  218  2e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.245868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0043  tRNA-OTHER  100 
 
 		 102 bp  99.6  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.049603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0036  tRNA-Arg  84.55 
 
 		 123 bp  99.6  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0876357 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0021  tRNA-Ser  98 
 
 		 104 bp  91.7  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.595381 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0010  tRNA-OTHER  96.23 
 
 		 103 bp  89.7  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262491 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0008  tRNA-Ser  96 
 
 		 98 bp  83.8  0.000000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0027  tRNA-OTHER  95.74 
 
 		 100 bp  77.8  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0014  tRNA-Ser  95.74 
 
 		 98 bp  77.8  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0029  tRNA-Ser  90.16 
 
 		 88 bp  73.8  0.000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0017  tRNA-Ser  90.16 
 
 		 88 bp  73.8  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544015  hitchhiker  0.0000175042 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0030  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0018  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0150168  hitchhiker  0.0000162071 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0025  tRNA-Ser  88.52 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0031  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.334076  hitchhiker  0.00102641 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0031  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 89 bp  58  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.137848  normal  0.0108409 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0018  tRNA-OTHER  100 
 
 		 110 bp  54  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0030  tRNA-Ser  100 
 
 		 101 bp  54  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.329697  hitchhiker  0.00107888 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0033  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 100 bp  50.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0033  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 89 bp  48.1  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0030  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0049  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00365867  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0009  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0342668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000058475 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00069315 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.491326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.311496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0444691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0007  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0422761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0049  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000106187  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0029  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.307428  hitchhiker  0.00000285444 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.563034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.415053 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0005  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0006  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0582006 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000026789 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0005  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.936331 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.248338  normal  0.650257 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0042  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.552525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0035  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0040  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.66072  hitchhiker  0.00010969 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0053  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00100217  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0025  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0018  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.424159  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0020  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00576144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0020  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0011  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.371979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0001  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 89 bp  44.1  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514478  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0008  tRNA-Lys  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0194876  normal  0.882608 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0033  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.981305 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>