More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_R0049 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_R0049  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000106187  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0049  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00365867  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0035  tRNA-Met  98.68 
 
 
77 bp  143  7e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1603  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0012  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.112019  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0560  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0030  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.299355 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0064  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0060  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0040  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.321259 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-3  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-4  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0026  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0305546  normal  0.617665 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1982  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2752  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0070  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.770554  normal  0.621408 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0019  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119121  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2677  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1829  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0390  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1857  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2507  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0052  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491192  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0034  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0047  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.808514  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0031  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0043  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0056  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401301  normal  0.029437 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0046  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140483  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3081  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2238  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.869817  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2621  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0046  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0060  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0044  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.3828  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0068  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0046  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1510  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.268798  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0772  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244521  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1813  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1732  tRNA-Met  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0054  tRNA-Met  94.37 
 
 
74 bp  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0068  tRNA-Met  94.37 
 
 
74 bp  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0078  tRNA-Met  94.37 
 
 
74 bp  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna34  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.775098  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0016  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69639  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0068  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0030  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0023  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.247152  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0002  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0035  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.575749  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0014  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0069  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0005  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0088  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0002  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0016  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0676778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0045  tRNA-Met  93.15 
 
 
74 bp  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00820009  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0046  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.363544  normal  0.0435272 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0383  tRNA-Met  92.21 
 
 
79 bp  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0008  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100905  hitchhiker  0.00491713 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0014  tRNA-Met  92.11 
 
 
77 bp  103  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0042  tRNA-Met  92.11 
 
 
77 bp  103  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238456  normal  0.634383 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0039  tRNA-Met  92.11 
 
 
77 bp  103  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0034  tRNA-Met  92.11 
 
 
77 bp  103  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0041  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0831228  normal  0.361197 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0046  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.918384  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0082  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0047  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0039  tRNA-Met  91.78 
 
 
74 bp  97.6  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0061  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-2  tRNA-Met  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03939  tRNA-Met  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS03940  tRNA-Met  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0023  tRNA-Met  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205789  normal  0.0373381 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0052  tRNA-Met  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0858392  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R19  tRNA-Met  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000168289  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0070  tRNA-Met  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0027  tRNA-Met  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0686525  normal  0.260083 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0010  tRNA-Met  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00010521  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0070  tRNA-Met  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.734677  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0071  tRNA-Met  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957172  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0022  tRNA-Met  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136375  normal  0.0369046 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0026  tRNA-Met  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0368817  normal  0.25242 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0023  tRNA-Met  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.216301  normal  0.182837 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0049  tRNA-Met  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0512381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5465  tRNA-Met  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.239722  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0034  tRNA-Met  90.67 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0131764 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60370  tRNA-Met  91.55 
 
 
74 bp  93.7  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0029  tRNA-Met  93.65 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62790  tRNA-Met  91.55 
 
 
74 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60270  tRNA-Met  91.55 
 
 
74 bp  93.7  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0054  tRNA-Met  93.55 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0017  tRNA-Met  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0043  tRNA-Met  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0017  tRNA-Met  89.47 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.687744  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0030  tRNA-Met  89.47 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00091315  normal  0.388606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>