44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_R0061 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_R0063  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  172  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0061  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.017138 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0005  tRNA-Ser  89.89 
 
 		 89 bp  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0472485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0063  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 89 bp  73.8  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0007  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0066  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.332689 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0029  tRNA-Ser  87.93 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26140  tRNA-Ser  82.76 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0074  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0004  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.303536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0004  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0004  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0005  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.933104  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0017  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0043  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0101  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.174048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0058  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0004  tRNA-Ser  88.1 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0773482 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0005  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.507885  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0056  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0005  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0001  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514478  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_513  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0001  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNASerVIMSS1309348  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366383 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0061  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.388434  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309077  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.537864  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt03  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.038347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0008  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.59905e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0019  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0026  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0033  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0002  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000138039  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0027  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0815  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0378889  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0027  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNASerVIMSS1309109  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.701033  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNASerVIMSS1309153  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0006  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.121639  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0009  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0020  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.437466  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0526  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0043  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.44549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>